Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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CDSNQ15517 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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