Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
R3HDM1Q15032 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HDM1Q15032 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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