Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC7Q15024 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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