Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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