Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms