Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GBX1Q14549 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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