Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SQLEQ14534 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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