Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VGLL4Q14135 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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