Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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