Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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