Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PDE3BQ13370 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
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