Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGDRQ13258 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDRQ13258 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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