Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2BQ13224 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2BQ13224 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms