Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms