Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX3Q13185 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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