Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CALCOCO2Q13137 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CALCOCO2Q13137 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CALCOCO2Q13137 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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