Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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