Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACACAQ13085 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACACAQ13085 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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