Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STX4Q12846 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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STX4Q12846 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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STX4Q12846 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STX4Q12846 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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STX4Q12846 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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STX4Q12846 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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STX4Q12846 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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STX4Q12846 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STX4Q12846 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
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