Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPTFQ12830 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPTFQ12830 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms