Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

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Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 KOG1YHR186C 4674 nt2.57□□□□□ -2
WSC3Q12215 SRB8YCR081W 4284 nt2.57□□□□□ -2
WSC3Q12215 PRP8YHR165C 7242 nt2.56□□□□□ -2
WSC3Q12215 ILS1YBL076C 3219 nt2.56□□□□□ -2
WSC3Q12215 CIN8YEL061C 3003 nt2.55□□□□□ -2
WSC3Q12215 PAU12YGR294W 363 nt2.55□□□□□ -2
WSC3Q12215 SGS1YMR190C 4344 nt2.54□□□□□ -2
WSC3Q12215 MOT1YPL082C 5604 nt2.54□□□□□ -2
WSC3Q12215 DNA2YHR164C 4569 nt2.54□□□□□ -2
WSC3Q12215 CYR1YJL005W 6081 nt2.54□□□□□ -2
WSC3Q12215 TOM1YDR457W 9807 nt2.53□□□□□ -2
WSC3Q12215 HIR3YJR140C 4947 nt2.53□□□□□ -2
WSC3Q12215 SLH1YGR271W 5904 nt2.53□□□□□ -2
WSC3Q12215 UTP21YLR409C 2820 nt2.53□□□□□ -2
WSC3Q12215 GEA1YJR031C 4227 nt2.53□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 PET309YLR067C 2898 nt2.52□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 PRP16YKR086W 3216 nt2.52□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.52□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.52□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.52□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 HUG1YML058W-A 207 nt2.52□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 STH1YIL126W 4080 nt2.52□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.51□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 MLP2YIL149C 5040 nt2.51□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 GIP3YPL137C 3831 nt2.51□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 FAR11YNL127W 2862 nt2.5□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 GEA2YEL022W 4380 nt2.5□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 RAD50YNL250W 3939 nt2.48□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 ESC1YMR219W 4977 nt2.48□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 YPL216WYPL216W 3309 nt2.47□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 UBR1YGR184C 5853 nt2.47□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 AXL1YPR122W 3627 nt2.47□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 DRS2YAL026C 4068 nt2.47□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 SPF1YEL031W 3648 nt2.47□□□□□ -2.01
WSC3Q12215 UTP22YGR090W 3714 nt2.46□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 HSL1YKL101W 4557 nt2.46□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.45□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 TOP2YNL088W 4287 nt2.45□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 KAP122YGL016W 3246 nt2.44□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 snR70snR70 164 nt2.44□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 SEC7YDR170C 6030 nt2.44□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 YMR160WYMR160W 2451 nt2.44□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 ATG9YDL149W 2994 nt2.43□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.42□□□□□ -2.02
WSC3Q12215 MSB2YGR014W 3921 nt2.4□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 YER090C-AYER090C-A 90 nt2.4□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 UBP2YOR124C 3819 nt2.39□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 FLO11YIR019C 4104 nt2.39□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 SAP1YER047C 2694 nt2.39□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.39□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 PSD2YGR170W 3417 nt2.39□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 HER1YOR227W 3741 nt2.38□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 ECM29YHL030W 5607 nt2.37□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 SMC4YLR086W 4257 nt2.37□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt2.37□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 BCK1YJL095W 4437 nt2.37□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 FYV8YGR196C 2454 nt2.36□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 ESL2YKR096W 3588 nt2.36□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 CHC1YGL206C 4962 nt2.35□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 REV3YPL167C 4515 nt2.34□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 KRE33YNL132W 3171 nt2.34□□□□□ -2.03
WSC3Q12215 FKS3YMR306W 5358 nt2.34□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 INO80YGL150C 4470 nt2.33□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 BNR1YIL159W 4128 nt2.32□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 YOL098CYOL098C 3114 nt2.32□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 NUM1YDR150W 8247 nt2.31□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.3□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.3□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.3□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.3□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.3□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.3□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 NUP170YBL079W 4509 nt2.28□□□□□ -2.04
WSC3Q12215 snR67snR67 82 nt2.26□□□□□ -2.05
WSC3Q12215 TRA1YHR099W 11235 nt2.25□□□□□ -2.05
WSC3Q12215 NUP192YJL039C 5052 nt2.24□□□□□ -2.05
WSC3Q12215 APL3YBL037W 3078 nt2.23□□□□□ -2.05
WSC3Q12215 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.22□□□□□ -2.05
WSC3Q12215 YLR419WYLR419W 4308 nt2.22□□□□□ -2.05
WSC3Q12215 SEC16YPL085W 6588 nt2.21□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 SKI3YPR189W 4299 nt2.2□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.2□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 SEC31YDL195W 3822 nt2.2□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 RAV1YJR033C 4074 nt2.19□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 PDR11YIL013C 4236 nt2.18□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt2.18□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 NUP145YGL092W 3954 nt2.17□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 SWI4YER111C 3282 nt2.16□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 IRA2YOL081W 9240 nt2.16□□□□□ -2.06
WSC3Q12215 SPT7YBR081C 3999 nt2.12□□□□□ -2.07
WSC3Q12215 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.12□□□□□ -2.07
WSC3Q12215 NEO1YIL048W 3456 nt2.12□□□□□ -2.07
WSC3Q12215 BNI1YNL271C 5862 nt2.1□□□□□ -2.07
WSC3Q12215 CSF1YLR087C 8877 nt2.09□□□□□ -2.07
WSC3Q12215 NUP188YML103C 4968 nt2.09□□□□□ -2.07
WSC3Q12215 UBR2YLR024C 5619 nt2.08□□□□□ -2.08
WSC3Q12215 CFT1YDR301W 4074 nt2.08□□□□□ -2.08
WSC3Q12215 CLU1YMR012W 3834 nt2.08□□□□□ -2.08
WSC3Q12215 TOR1YJR066W 7413 nt2.04□□□□□ -2.08
WSC3Q12215 snR77snR77 88 nt2.04□□□□□ -2.08
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