Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFFO1Q0D2I5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms