Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC8Q09428 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms