Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM27E3Q08E93 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms