Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4DQ08499 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms