Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms