Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms