Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPAQ06546 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms