Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF11Q05519 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms