Protein–RNA interactions for Protein: Q04893

YMR317W, Uncharacterized protein YMR317W, yeastyeast

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR317WQ04893 SOM1YEL059C-A 225 nt1.19□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 snR39BsnR39B 96 nt1.19□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 SEC21YNL287W 2808 nt1.18□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 YDR544CYDR544C 429 nt1.18□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.18□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 FYV8YGR196C 2454 nt1.18□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 WAR1YML076C 2835 nt1.18□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 NOP9YJL010C 2001 nt1.18□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 YML002WYML002W 2214 nt1.17□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 NUP188YML103C 4968 nt1.17□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.16□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 CCH1YGR217W 6120 nt1.16□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 FYV10YIL097W 1551 nt1.16□□□□□ -2.22
YMR317WQ04893 CLU1YMR012W 3834 nt1.15□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 EST2YLR318W 2655 nt1.14□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 LAA1YJL207C 6045 nt1.14□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 YMR326CYMR326C 309 nt1.14□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 snR190snR190 190 nt1.14□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 YGR130CYGR130C 2451 nt1.14□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 APL3YBL037W 3078 nt1.14□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 ASE1YOR058C 2658 nt1.13□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.12□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 YCS4YLR272C 3531 nt1.11□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 SWI4YER111C 3282 nt1.11□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 snR61snR61 90 nt1.11□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 NST1YNL091W 3723 nt1.1□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 RPL26BYGR034W 384 nt1.1□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 YLR041WYLR041W 321 nt1.1□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 YLR232WYLR232W 348 nt1.1□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.1□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 IML1YJR138W 4755 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.09□□□□□ -2.23
YMR317WQ04893 AZF1YOR113W 2745 nt1.09□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 CDC39YCR093W 6327 nt1.08□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 YHR217CYHR217C 462 nt1.08□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 RCO1YMR075W 2055 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 MYO1YHR023W 5787 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 ROM2YLR371W 4071 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 RAD9YDR217C 3930 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 YDR210WYDR210W 228 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 STF2YGR008C 255 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 NUP145YGL092W 3954 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 COG6YNL041C 2520 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 CDC25YLR310C 4770 nt1.04□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.03□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 HUG1YML058W-A 207 nt1.03□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 SEC3YER008C 4011 nt1.03□□□□□ -2.24
YMR317WQ04893 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 PRP16YKR086W 3216 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 KAP120YPL125W 3099 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 SEC1YDR164C 2175 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 BUD3YCL014W 4911 nt1□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 SEC8YPR055W 3198 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 SIP4YJL089W 2490 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 YDL073WYDL073W 2955 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 BEM3YPL115C 3387 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR317WQ04893 BIR1YJR089W 2865 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 SBH1YER087C-B 249 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 YNL266WYNL266W 420 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 UBP3YER151C 2739 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 SPT7YBR081C 3999 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 snR81snR81 201 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 YJR029WYJR029W 5268 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 VAM6YDL077C 3150 nt0.9□□□□□ -2.26
YMR317WQ04893 NNF2YGR089W 2811 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 RKR1YMR247C 4689 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 DOP1YDR141C 5097 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 YSP1YHR155W 3687 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 BEM2YER155C 6504 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 SCC2YDR180W 4482 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 GLG1YKR058W 1851 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR317WQ04893 YPR117WYPR117W 7470 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR317WQ04893 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR317WQ04893 SEC10YLR166C 2616 nt0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.6 ms