Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREMQ03060 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREMQ03060 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms