Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC6A3Q01959 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms