Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPCQ01831 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPCQ01831 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPCQ01831 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPCQ01831 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XPCQ01831 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XPCQ01831 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
XPCQ01831 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPCQ01831 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms