Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms