Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms