Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITPNAQ00169 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms