Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX1P78337 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX1P78337 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX1P78337 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX1P78337 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX1P78337 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX1P78337 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX1P78337 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITX1P78337 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX1P78337 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX1P78337 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX1P78337 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX1P78337 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX1P78337 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX1P78337 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX1P78337 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms