Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2LP62875 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2LP62875 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms