Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP25P60880 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms