Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDL3P58872 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms