Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA9P57773 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJA9P57773 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA9P57773 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA9P57773 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms