Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP12AP54707 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms