Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms