Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCR4P51679 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCR4P51679 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCR4P51679 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCR4P51679 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCR4P51679 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms