Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPAP49450 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms