Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK8P49336 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK8P49336 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK8P49336 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK8P49336 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms