Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD2P49005 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD2P49005 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD2P49005 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD2P49005 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLD2P49005 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD2P49005 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD2P49005 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms