Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCCP43146 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCCP43146 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DCCP43146 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCCP43146 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCCP43146 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DCCP43146 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
DCCP43146 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DCCP43146 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DCCP43146 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCCP43146 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCCP43146 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCCP43146 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DCCP43146 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCCP43146 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCCP43146 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCCP43146 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms