Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MLH1P40692 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MLH1P40692 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MLH1P40692 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MLH1P40692 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLH1P40692 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MLH1P40692 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms