Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNB1P35222 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNB1P35222 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms